Veelal komt een Medimo afdeling overeen met de daadwerkelijke afdeling. In een aantal gevallen is in Medimo de afdeling gesplitst. Dit speelt vaak bij afdelingen waar cliënten met- en zonder behandeling verblijven. Doorgaans zijn voor deze 2 type cliënten verschillende werkwijze voor het invoeren van medicatie. Vanwege deze verschillende werkwijzen wordt in Medimo de afdeling meestal gesplitst. Normaal betekent dit dat de zorg in Medimo met 2 afdelingen (en dus 2 werklijsten) moet werken terwijl dit in de praktijk 1 afdeling is.
Door de afdelingen te laten groeperen voegt Medimo de afdelingen samen waardoor de zorg met 1 werklijst kan werken ondanks dat dit in Medimo 2 of meer afdelingen zijn. Hierdoor komt het voor de zorg beter overeen met de praktijk.
Het groeperen is niet beperkt tot het cluster. Er kunnen dus afdelingen worden gegroepeerd die onder een ander cluster vallen (bijvoorbeeld een cluster met behandeling en een cluster zonder behandeling). Doordat het groeperen cluster overstijgend is, wordt dit ingericht door de Medimo helpdesk. Stem daarmee af wanneer en welke afdelingen er gegroepeerd dienen te worden.